https://frosthead.com

Περιγραφή πρώτων ειδών σπονδυλωτών με γραμμικό κώδικα DNA

Το Δεκέμβριο του 1982, ο Βενιαμίν Βίκτορ, ιδρυτής της ερευνητικής πρωτοβουλίας Ocean Science Science, πραγματοποίησε καταδύσεις σε έναν ύφαλο λίγο ανοιχτό από τον σταθμό Smithsonian Tropical Research Institute, όταν έφτιαξε έναν ενήλικα goby. Το ψάρι φαινόταν ελαφρώς διαφορετικό από το γόνιο του Ατλαντικού, αλλά τα χαρακτηριστικά του δεν ήταν αρκετά μοναδικά ώστε να το δηλώνουν ένα νέο είδος.

Ο Victor υποψιάστηκε ότι οι διαφορές έπεσαν βαθιά στο γενετικό μακιγιάζ του goby, αλλά το σύστημα ταυτοποίησης των ειδών, βασισμένο αποκλειστικά σε φυσικά αναγνωριστικά στοιχεία όπως σήματα, αριθμούς πτερυγίων και σχήματα οστών, τον απέτυχε. Θα χρειαζόταν ένα δεύτερο δείγμα και ανάλυση DNA. Έτσι, το δείγμα κάθισε και καθόταν - για το γραφείο του Βίκτωρα - για σχεδόν 25 χρόνια.

Τον Μάρτιο του 2006, ο Dave Jones της Εθνικής Υπηρεσίας Θαλάσσιας Αλιείας συγκέντρωσε ένα δείγμα νύμφης που θυμίζει τον gobik του Victor σε μια παγίδα του Yucatan του Μεξικού. Από εκεί, η νέα ταξινομική τεχνική του barcoding επέτρεψε στον Victor να ταιριάξει το DNA της προνύμφης με εκείνη του ενήλικα και να δηλώσει το goby ένα νέο είδος, το οποίο αποκλίνει από το Ατλαντικό goby kin με ένα επιβλητικό 25 τοις εκατό (να θυμάστε: και χιμπατζήδες είναι μόνο 1-2 τοις εκατό διαφορετικά).

Η απαίτηση της φήμης του ψαριού είναι ότι η ταυτότητά του έχει καρφωθεί από ένα barcode DNA. Ο γραμμωτός κώδικας, που λαμβάνεται από μια συμφωνημένη θέση στο γονιδίωμα, ενεργεί σαν ένα barcode του καταναλωτικού προϊόντος, καθώς σφραγίζει τη συμφωνία όσον αφορά την ταυτοποίηση.

Με το όνομα Coryphopterus kuna, το goby έχει γίνει το πρώτο είδος των σπονδυλωτών που περιλαμβάνει το DNA barcode του στην περιγραφή των επίσημων ειδών του. Περίπου 30.000 γνωστά είδη, από μανιτάρια έως πουλιά, έχουν γραμματογραφηθεί, αλλά σε όλες τις περιπτώσεις τα είδη βρέθηκαν και περιγράφηκαν επιστημονικά πριν δημιουργηθούν οι γραμμωτοί κώδικες. Η πρωτοβουλία Barcode of Life, της οποίας το ινστιτούτο Smithsonian είναι εταίρος, προτρέπει τα μικρά τμήματα του DNA να συλλεχθούν και να τεθούν σε βάση δεδομένων ανοικτής πρόσβασης.

"Δεν υπήρχε κανένας τρόπος να καταστεί εύκολη και συνεπής η ταυτοποίηση ενός ψαριού. Συνήθως έπρεπε να είσαι ειδικός και θα έπρεπε να έχεις ένα καλό δείγμα ενηλίκων για να το εξετάσεις και τότε ήταν η γνώμη σου", λέει ο Βίκτωρ της ταξινόμησης πριν από το barcoding. "Τώρα, όποιος έχει πρόσβαση στην τεχνολογία barcoding μπορεί να πει σίγουρα, η ακολουθία ταιριάζει με το είδος X, ακόμα κι αν αυτό που έχετε είναι ένα αυγό, μια προνύμφη ή μια κλίμακα ή κομμάτι του δέρματος".

(Ευγενική παραχώρηση του STRI)

Περιγραφή πρώτων ειδών σπονδυλωτών με γραμμικό κώδικα DNA