https://frosthead.com

Tardigrades Ανακατέψτε τη διαμάχη και Showcase Επιστήμη σε δράση

Δεν υπάρχει καμία αμφιβολία ότι τα μικροσκοπικά υδρόβια ασπόνδυλα γνωστά ως tardigrades, χοιρίδια βρύου ή αρκούδες είναι περίεργα. Οι παράξενα πλάσματα μπορούν να επιβιώσουν στο κενό του χώρου, να υπομείνουν αποξήρανση από την ξηρασία και να αναδυθούν ζωντανοί μετά την κατάψυξη, μεταξύ άλλων πραγμάτων. Μια πρόσφατη μελέτη υποδηλώνει ότι οι tardigrades είναι επίσης γονιδιακοί κτηνοτρόφοι - ότι τα γονιδιώματα τους κατέχουν περισσότερο DNA από μη σχετιζόμενα φυτά, βακτήρια και άλλα μικρόβια από οποιοδήποτε άλλο ζώο στη Γη, όπως ανέφερε πρόσφατα η Rachel Nuwer για το Smithsonian.com . Αυτή η ικανότητα θα μπορούσε να εξηγήσει ακόμη και γιατί τα tardigrades είναι τόσο ανθεκτικά, προτείνουν οι ερευνητές.

Αλλά περίπου μία εβδομάδα μετά την ανακοίνωση αυτής της εκπληκτικής ανακάλυψης, μια άλλη ομάδα αμφισβήτησε τα ευρήματα, αναφέρει ο Ed Yong για τον Ατλαντικό . Η γρήγορη μετακίνηση μεταξύ των δύο ομάδων καταδεικνύει πόσο ευαίσθητη και δυνητικά αυτορυθμιζόμενη επιστήμη μπορεί να είναι στην ψηφιακή εποχή.

Η πρώτη μελέτη, από ομάδα που εδρεύει στο Πανεπιστήμιο της Βόρειας Καρολίνας, ανέφερε ότι ένα είδος tardigrade μεταφέρει ένα επιβλητικό 6, 600 γονίδια που αρχικά ανήκαν σε οργανισμούς από άλλα βασίλεια - κυρίως βακτήρια, αλλά και μύκητες, φυτά, ιούς και αρχαίους. διαδικασία που ονομάζεται οριζόντια μεταφορά γονιδίων. Τα ευρήματα αυτά σήμαιναν ότι το γονιδίωμα του Hypsibius dujardini αποτελείται από περίπου 17, 5% ξένο DNA, ανέφερε η ομάδα σε Πρακτικά της Εθνικής Ακαδημίας Επιστημών . Επειδή μερικά από τα ξένα γονίδια εμπλέκονται σε απαντήσεις στο άγχος άλλων οργανισμών, οι ερευνητές υποψιάζονται ότι θα μπορούσαν να δώσουν tardigrades με μερικές από τις δικές τους μοναδικές ικανότητες για καιρικές συνθήκες.

Ωστόσο, μια δεύτερη ομάδα από το Πανεπιστήμιο του Εδιμβούργου ανέλυσε επίσης το ίδιο είδος tardigrade και πήρε πολύ διαφορετικά αποτελέσματα. Αυτοί οι ερευνητές βρήκαν ότι το critter έχει μεταξύ 36 και 500 οριζόντια μεταφερμένα γονίδια - ένα πολύ μικρότερο ποσοστό. Όταν το έγγραφο UNC βγήκε, τα αποτελέσματα του Εδιμβούργου ήταν ακόμη αδημοσίευτα, αλλά οι ερευνητές προσπάθησαν να δημοσιεύσουν τα ευρήματά τους στον server preprint bioRxiv.org - μια ιστοσελίδα όπου μπορούν να δημοσιευθούν χειρόγραφα προτού υποβληθούν σε ένα περιοδικό και η επισκόπηση από ομοτίμους τυπική επιστημονική έρευνα.

Η ομάδα του Εδιμβούργου υποπτεύεται ότι η ομάδα του UNC μπορεί να έχει «προσδιορίσει την αλληλουχία του DNA από βακτηρίδια που ζούσαν παράλληλα με τους tardigrades και, παρά τις καλύτερες προσπάθειές τους, είχαν τα λάθη των γονιδίων αυτών των μικροβίων για γνήσια γονίδια tardigrade» γράφει ο Yong. Αλλά πώς θα μπορούσε η πρώτη ομάδα να μπερδευτεί, αν πράγματι είναι; Ο Yong εξηγεί ότι η τεχνολογία στα γονιδιώματα αλληλουχίας περιλαμβάνει το τεμαχισμό του DNA σε μικρά κομμάτια και στη συνέχεια την επανασυναρμολόγηση των δυαδικών ψηφίων σε μια συνεκτική εικόνα. Κάποια μόλυνση μπορεί εύκολα να γλιστρήσει μέσα, έτσι οι επιστήμονες καταβάλλουν προσπάθεια να καταλάβουν ποια κομμάτια ανήκουν στον οργανισμό που μελετούν, αντί για τα μικρόβια που βρίσκονται κοντά.

Η ομάδα του Εδιμβούργου συνειδητοποίησε ότι ορισμένα από τα θραύσματα DNA ήταν σπάνια, σε σύγκριση με άλλα θραύσματα. "Δεν υπάρχει τρόπος, βιολογικά, αυτά να μπορούν να είναι μέρος του ίδιου γονιδιώματος", λέει ο Yong ο ηγέτης της ομάδας Mark Blaxter. Η ομάδα κατέληξε στο συμπέρασμα ότι υπάρχουν 500 γονίδια στο γονιδίωμα του tardigrade που θα μπορούσαν να προέρχονται από άλλες πηγές, αλλά έχουν μόνο ισχυρά στοιχεία για 36 από αυτά. Αυτό δίνει στο tardigrade ένα πολύ πιο τυπικό ποσοστό ξένου DNA για ένα ζώο.

Σε ένα σχόλιο σχετικά με το νεώτερο άρθρο, οι Thomas Boothby και Bob Goldstein από την UNC επισημαίνουν ότι γνώριζαν αυτό το πιθανό πρόβλημα και εργάστηκαν σκληρά για να εξασφαλίσουν ότι δεν θα επηρέαζαν τα αποτελέσματά τους- αλλά ότι υπάρχει πάντα πιθανότητα σφάλματος. Προσθέτουν ότι θα κάνουν πρόσθετη ανάλυση πριν κάνουν περαιτέρω σχόλια. Οι ερευνητές επίσης δήλωσαν ότι εκτιμούσαν την απόφαση των αντιπάλων τους να δημοσιεύσουν τα αντιφατικά τους αποτελέσματα τόσο γρήγορα στο bioRxiv.org .

Τα συναισθήματα ήταν αμοιβαία. Ο Sujai Kumar από την ομάδα του Εδιμβούργου δήλωσε στον Yong ότι εάν η ομάδα UNC δεν είχε δημοσιεύσει τα στοιχεία της αμέσως, θα ήταν πιο δύσκολο για την ομάδα τους. "Αυτό που είναι εμφανές είναι η εκπληκτική νέα ικανότητα της επιστήμης να αυτο-διορθώνεται γρήγορα", λέει ο Blaxter Yong. Αυτό που πήρε μόλις εννέα ημέρες στην περίπτωση αυτή θα είχε πάρει μήνες στο παρελθόν.

Προς το παρόν, η κριτική επιτροπή είναι ακόμα έξω για το πόσο από το γονιδίωμα του tardigrade προέρχεται από ξένες πηγές. Αλλά ακόμα κι αν αυτά τα μικροσκοπικά πλάσματα δεν είναι γονίδια stealers, μπορεί να είναι επικεφαλής κλοπές για λίγο περισσότερο.

Σημείωση συντάκτη: Αυτό το άρθρο επεξεργάστηκε η Rachel Nuwer, η οποία αρχικά ανέφερε σχετικά με την έρευνα tardigrade για Smithsonian.com.

Tardigrades Ανακατέψτε τη διαμάχη και Showcase Επιστήμη σε δράση